Таксономический состав прокариотических сообществ почв археологических памятников Восточного Крыма

Игорь Александрович Шаев; Виктор Николаевич Пинской; Елена Владиславовна Чернышева; Анастасия Владимировна Потапова; Татьяна Николаевна Смекалова; Александр Владимирович Борисов

doi:10.31251/pos.v9i2.346

Авторы

Игорь Александрович Шаев ФГБУН Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения им. В.А. Ковды РАН, г. Пущино, Россия https://orcid.org/0009-0006-9990-967X
Виктор Николаевич Пинской ФГБУН Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения им. В.А. Ковды РАН, г. Пущино, Россия
Елена Владиславовна Чернышева ФГБУН Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения им. В.А. Ковды РАН, г. Пущино, Россия https://orcid.org/0000-0002-8526-4798
Анастасия Владимировна Потапова ФГБУН Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения им. В.А. Ковды РАН, г. Пущино, Россия https://orcid.org/0000-0002-7846-9103
Татьяна Николаевна Смекалова ФГАОУ ВО «Крымский федеральный университет им. В.И. Вернадского», Симферополь, Республика Крым, Россия https://orcid.org/0000-0001-5378-5372
Александр Владимирович Борисов ФГБУН Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения им. В.А. Ковды РАН, г. Пущино, Россия https://orcid.org/0000-0001-5031-7477

DOI:

https://doi.org/10.31251/pos.v9i2.346

Ключевые слова:

метабаркодинг; 16S рРНК; Methanomassiliicoccus intestinalis; антропогенная деятельность; эпоха бронзы; степная зона.

Аннотация

Цель исследования. Выявить закономерности трансформаций прокариотического микробиома почв в результате разных форм антропогенного воздействия в прошлом. В задачи исследования входило изучить физико-химические свойства почв и определить таксономический состав почвенных прокариотических сообществ в культурных слоях археологических памятников эпохи бронзы Восточного Крыма.

Место и время проведения. Объектами исследования являются почвы древних поселений эпохи поздней бронзы (XIV–XII вв. до н.э.) Джарган Кая, Ташларка и Сагун Дык Кая в степной зоне Восточного Крыма. Раскопки поселений и отбор образцов проводили в апреле 2024 г.

Методы. Выделение почвенной дц-ДНК, ПЦР, секвенирование.

Основные результаты. Антропогенное воздействие на почвы, имевшее место в период 3500–3200 лет назад, привело к изменениям в составе прокариотических сообществ. Поступление в почву больших объемов органических материалов антропогенной природы привело к увеличению в культурных слоях долей представителей типов Candidatus Thermoplasmatota и Gemmatimonadota. В составе Ca. Thermoplasmatota доминирующим видом является Ca. Methanomassiliicoccus intestinalis. При этом повышенное содержание метаногенов в культурных слоях не сопровождается пропорциональным увеличением содержания метанотрофных микроорганизмов.

Заключение. Культурные слои археологических памятников являются уникальными объектами для изучения истории развития микробного разнообразия в почвах и вклада антропогенной деятельности в формирование современного микробиома почв. Этот вклад заключается, главным образом, в повышении содержания представителей Ca. Thermoplasmatota, в числе которых наиболее представленным является Ca. Methanomassiliicoccus intestinalis.